رؤساء مجلس الأمناء المتعاقبون:
منذ أن تأسس المجلس تعاقبت على رئاسته شخصيتان هما:
| اسم الرئيس | فترة الرئاسة | |
| 1 | الدكتور عبد المحسن بن عبد الله التركي من المملكة العربية السعودية |
1986- 1992م |
| 2 | سعادة السفير ناصر بن عبد الله بن حمدان الزعابي من دولة الإمارات العربية المتحدة |
1992م- إلى الآن |
رؤساء الجامعة المتعاقبون:
منذ أن تم افتتاح الجامعة الإسلامية بالنيجر، تشرف برئاستها الشخصيات الآتية:
| ر.م | اسم الرئيس | فترة الرئاسة |
| 1 | الدكتور محمد جميل خياط من المملكة العربية السعودية | 1986- 1988م |
| 2 | الدكتور صالح بن حمد العساف من المملكة العربية السعودية | 1988- 1990م |
| 3 | الأستاذ الدكتور مختار محمد المختار ولد أباه من جمهورية موريتانيا الإسلامية | 1990- 1991م |
| 4 | الأستاذ الدكتور جيبو هماني من جمهورية النيجر | 1991م |
| 5 | السفير بكري درامي من جمهورية مالي | 1993- 1994م |
| 6 | الأستاذ الدكتور عبد العلي الودغيري من المملكة المغربية | 1994- 2005م |
| 7 | الدكتور إبراهيم أمين رئيسا بالنيابة من جمهورية تشاد | 2005- 2008م |
| 8 | الأستاذ الدكتور عبد الجواد السقاط من المملكة المغربية | 2008 – 2013م |
| 9 | الأستاذ الدكتور المنصف الجزار من الجمهورية التونسية |
2013 – 2018م |
| 10 | الأستاذ الدكتور جمال بن طاهر من الجمهورية التونسية انظر السيرة الذاتية | من فاتح نوفمبر2018 إلى الآن |